本市境内自然灾害主要有:旱灾、涝灾、干热风、冰雹、霜冻,尤其是旱、涝灾害对农业生产影响最大。据历史资料统计:1368~2000年,632年中共发生旱灾303次,平均2.08年一遇。其中特大旱灾37次,平均17.08年一次,大体上相当于平均20年一遇的周期,近年有逐步加重趋势,1998年秋至2000年春连续干旱;涝灾230次,平均2.7年一遇。1990年、1994年、1996年、1998年发生了较大涝灾。干热风平均5年3次,影响小麦产量5~20%;过去冰雹年年发生,多在棉花苗期和小麦成熟期,近年由于林木覆盖率提高和人工防雹措施的实施,冰雹危害有较大减轻。2003年6月28日凌晨,本市平原、禹城、齐河、临邑四县(市)曾遭受特大风雹灾害,受灾面积达72万多亩,造成农作物受损、部分房屋倒塌、电力通讯设施毁坏。另外,本市还有病虫害、龙卷风、大雾、连阴雨等灾害,对生产生活的影响也较为严重。